HE染色試劑盒的具體操作步驟如下：
 

　　1、取材，固定：固定液——甲醛(福爾馬林)
 

　　從人或動物新鮮尸體上取下組織塊投入預先配好的固定液中使組織、細胞的蛋白質變性凝固，以防止細胞死后的自溶或細菌的分解，從而保持細胞本來的形態(tài)結構。
 

　　2、修剪，脫水，透明：脫水劑——酒精
 

　　透明劑——二甲苯
 

　　不同組織固定時間不同，固定成功后需要修剪25px*25px*5px，放入包埋盒中，流水沖洗30分鐘。至于不同濃度的酒精脫水，一般用由低濃度到高濃度酒精作脫水劑，逐漸脫去組織塊中的水份。再將組織塊置于既溶于酒精，又溶于石蠟的透明劑二甲苯中透明，以二甲苯替換出組織塊的中酒精，才能浸蠟包埋。
 

　　3、浸蠟，包埋：石蠟
 

　　將已透明的組織塊置于已溶化的石蠟中，放入溶蠟箱保溫。待石蠟*浸入組織塊后進行包埋，冷卻凝固成塊即成。包埋好的組織塊變硬，才能在切片機上切成很薄的切片。
 

　　4、切片、展片、烤片：
 

　　將包埋好的蠟塊固定于切片機上，切成薄片，一般為5—8微米厚。切下的薄片往往皺折，要放到加熱的水中燙平，再貼到載玻片上，放45℃恒溫箱中烘干。
 

　　5、染色前，須用二甲苯脫去切片中的石蠟，再經由高濃度到低濃度酒精，最后入蒸餾水，就可染色。
 

　　蘇木精是一種堿性染料，可將細胞核和細胞內核糖體染成藍紫色，被堿性染料染色的結構具有嗜堿性。伊紅(Eosin，E)是一種酸性染料，能將細胞質染成紅色或淡紅色，被酸性染料染色的結構具有嗜酸性。